Die Hauptziele des Briefes von Paulus sind Versöhnung , die Kraft des Evangeliums, Menschen und die Gesellschaft zu verändern, und das Eintreten für diejenigen, die nicht in der Lage sind, sich selbst zu helfen. Paulus schrieb den Brief mit der Absicht, zwei Männer, Onesimus und Philemon, zusammenzubringen. Paulus hatte die einmalige Gelegenheit, zwei Brüdern in Christus die Möglichkeit zu geben, ihre Situation aus der Sicht des anderen zu sehen.

Der Apostel ließ zu, dass die beiden Brüder zu ihren eigenen Schlussfolgerungen kamen, gab aber wahrheitsgemäß die verständlichen Schlussfolgerungen beider Seiten wieder. Er schlug Philemon vor, Onesimus nicht als Sklaven, sondern als Mitbruder in Christus anzunehmen.